一般来说拟核是原核生物遗传物质存在的主要场所，没有核膜；而细胞核是真核生物遗传物质的主要场所，有核膜包围，核膜将细胞质和核质（染色质）核仁在一定程度分开。他们的功能都是储存遗传物质的，没有多大的差别。
拟核
（英语：nucleoid；意指“与核相似”，又译类核），也称核区（nuclear region）、核体（nuclear body）或染色质体（chromatin body）。
存在于原核生物，是没有由核膜包被的细胞核，也没有染色体，只有一个位于形状不规则且边界不明显区域的环形DNA分子，内含遗传物质。里面的核酸为双股螺旋形式的环状DNA，且同时具有多个相同的复制品。
细胞核
（拉丁语：nucleus）是存在于真核细胞中的封闭式膜状胞器，内部含有细胞中大多数的遗传物质，也就是DNA。这些DNA与多种蛋白质，如组织蛋白复合形成染色质。而染色质在细胞分裂时，会浓缩形成染色体，其中所含的所有基因合称为核基因。细胞核的作用，是维持基因的完整性，并借由调节基因表现来影响细胞活动。